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O advento das novas tecnologias de sequenciamento de DNA viabilizaram a concepção e execução de novos projetos, que se baseiem em abordagens como resequenciamento, sequenciamento de novo, genotipagem por sequenciamento, imputação, metagenômica, etc., mas que demandam armazenamento, tratamento e análise de uma quantidade muito grande de dados. O grande desafio deste projeto, na fase II da Rede Genômica Animal (RGA), é, em parceria com o Laboratório Multiusuário de Bionformática da Embrapa (LMB), ...

Situação: concluído     Data de Início: Tue Jan 01 00:00:00 GMT-03:00 2013

A identificação de genes de interesse econômico pode significar considerável vantagem competitiva em mercados cada vez mais competitivos e globalizados. Genes associados à resistência a pragas, aumento de produtividade e características organolépticas (que podem ser percebidas pelos sentidos humanos, como cor, sabor e textura) valorizadas pelos consumidores são extremamente importantes para a pecuária brasileira. A prospecção deles demanda ferramentas tanto de biotecnologia quanto de bioinformát ...

Situação: concluído     Data de Início: Tue Jan 01 00:00:00 GMT-03:00 2008

A computação utilizada como ferramenta pela pesquisa científica revolucionou as ciências biológicas, assim como fez com diversos outros campos da ciência e, considerando a quantidade exponencialmente crescente e a complexidade dos dados científicos que estão sendo gerados e que necessitam ser eficientemente manuseados, traduzidos, processados e comunicados, são necessários novos recursos computacionais para o tratamento eficaz de todo esse volume de dados que possibilite transformá-lo em conheci ...

Situação: concluído     Data de Início: Fri Apr 01 00:00:00 GMT-03:00 2011

As mudanças climáticas podem afetar a produtividade agrícola e devem impactar a produção de alimentos em um futuro próximo. A criação de cultivares tolerantes a estresses abióticos, como a seca por exemplo, pode ser uma das maneiras de se adaptar as culturas agrícolas a esses efeitos. O processo de criação de cultivares passa pela descoberta de genes, um processo computacional de seleção de genes por meio de análises de bioinformática usando genomas, vias biológicas, dados de expressão gênica, d ...

Situação: concluído     Data de Início: Sat Jul 01 00:00:00 GMT-03:00 2017

As mudanças climáticas podem afetar a produtividade agrícola e devem impactar a produção de alimentos em um futuro próximo. A criação de cultivares tolerantes a estresses abióticos, como a seca, pode ser uma das maneiras de se adaptar as culturas agrícolas a esses efeitos. O processo de criação de cultivares passa pela descoberta de genes, um processo computacional de seleção de genes por meio de análises de bioinformática usando genomas, vias biológicas, dados de expressão gênica, dados da lite ...

Situação: concluído     Data de Início: Tue Jan 01 00:00:00 GMT-03:00 2019

Fatores ambientais e estresses bióticos, como é o caso da ferrugem da folha do trigo, causada pelo fungo Puccinia triticina, têm afetado, com frequência, a produtividade e a qualidade do produto final do trigo. A ocorrência de epidemias de ferrugem da folha na região do Cone Sul da América do Sul, também afeta drasticamente a competitividade da cultura. No Brasil, a ferrugem da folha possui adaptação ao clima sul-brasileiro e o fungo possui elevada taxa de especialização fisiológica. Em decorrên ...

Situação: concluído     Data de Início: Tue Jan 01 00:00:00 GMT-03:00 2019

Nesse projeto busca-se estabelecer uma plataforma tecnológica, com cinco módulos independentes, que reduza a dependência de material genético de suínos e aumente a competitividade dos programas nacionais de melhoramento.

A plataforma tecnológica será desenvolvida por meio da parceria entre BRF e Embrapa, representada pelas unidades Suínos e Aves, Informática Agropecuária, Gado de Leite, Gado de Corte, Pecuária Sul e Recursos Genéticos e Biotecnologia.

Entre os objetivos do proj ...

Situação: concluído     Data de Início: Wed Jul 01 00:00:00 GMT-03:00 2015

As limitações impostas pelas mudanças climáticas já afetam a produtividade agrícola na maioria das regiões produtoras de alimentos e fibras do mundo e as projeções indicam que o problema deve se intensificar de forma continuada. É imprescindível que ações estruturadas com foco na busca de alternativas viáveis e eficazes sejam intensificadas para fazermos frente aos riscos que ameaçam a produção de alimentos. A Unidade Mista de Pesquisa em Genômica Aplicada a Mudanças Climáticas (Umip GenClima

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Situação: concluído     Data de Início: Sat Aug 01 00:00:00 GMT-03:00 2015

Este projeto tem como propostas desenvolver novos métodos computacionais em bioinformática por meio de workflows (gerenciamento de processos utilizados em experimentos científicos) para serem aplicados em análises de dados genômicos e capacitar pesquisadores brasileiros para análise de grandes conjuntos de sequências de DNA e RNA envolvidas nas áreas "ômicas" (genômica, transcriptômica, exômica, metagenômica e metatranscriptômica). As atividades vão ser desenvolvidas por uma equipe multidiscipli ...

Situação: concluído     Data de Início: Sat Mar 01 00:00:00 GMT-03:00 2014

A demanda por armazenamento e processamento de grandes volumes de dados em aplicações científicas tem se ampliado consideravelmente na atualidade, exigindo investimentos e aperfeiçoamento técnico por parte das organizações que têm a pesquisa e inovação como sua área fim. A Embrapa não é diferente e já enfrenta em vários de seus projetos um volume expressivo de dados; e percebendo o problema, tem desencadeado ações para mitigá-lo. Como exemplo, pode-se citar a criação do Laboratório Multiusuário ...

Situação: concluído     Data de Início: Mon Oct 01 00:00:00 GMT-03:00 2012