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A chromosome scale genome assembly of pensacola bahiagrass (paspalum notatum cv. pensacola) Autoria: ARAKAKI, J. E.; VIGNA, B. B. Z.; PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; MUDADU, M. de A.; RIOS, E.; FAVERO, A. P. The development of new, cost-effective sequencing technologies, along with user-friendly computational tools, facilitates genomic studies of non-model species. Paspalum notatum is an important forage... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2023
Applications of bioinformatics in agriculture. Autoria: ZERLOTINI NETO, A.; NHANI JÚNIOR, A.; VIEIRA, F. D.; CINTRA, L. C.; MUDADU, M. de A.; FALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. Introduction. LMB computational infrastructure to support bioinformatics projects applied to agriculture. Applications: ioinformatics and the tambaqui production chain; Bioinformatics in vaccine devel... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2023
Plant Co-expression Annotation Resource: a web server for identifying targets for genetically modified crop breeding pipelines. Autoria: VIANA, M. J. A.; ZERLOTINI NETO, A.; MUDADU, M. de A. Abstract. The development of genetically modified crops (GM) includes the discovery of candidate genes through bioinformatics analysis using genomics data, gene expression, and others. Proteins of unk... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2021
Machado: open source genomics data integration framework. Autoria: MUDADU, M. de A.; ZERLOTINI NETO, A. Abstract. Background: Genome projects and multiomics experiments generate huge volumes of data that must be stored, mined, and transformed into useful knowledge. All this information is supposed to be... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2020
Aplicações da bioinformática na agricultura. Autoria: ZERLOTINI NETO, A.; NHANI JÚNIOR, A.; VIEIRA, F. D.; CINTRA, L. C.; MUDADU, M. de A.; FALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. Introdução. Infraestrutura computacional do LMB para suporte a projetos de bioinformática aplicada à agropecuária. Aplicações. A bioinformática e a cadeia produtiva do tambaqui. Bioinformática no dese... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2020
Transcriptome analysis of Paspalum notatum and Paspalum vaginatum under water deficit condition. Autoria: ARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C.; VIGNA, B. B. Z. Drought is one of the abiotic stresses that most affect plant growth and productivity. Grasses of the genus Paspalum are successfully used as turf and forage in Australia, Argentina, Brazil and United... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2019
Transcriptome analysis of paspalum vaginatum under drought condition. Autoria: VIGNA, B. B. Z.; ARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C. Paspalum vaginatum Swartz, also known as seashore paspalum, is a halophytic, diploid, self-incompatible, warm-season perennial grass, well adapted to coastal regions in tropical and subtropical enviro... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2019
Machado: a genomic data integration framework for Chado developed with Django. Autoria: MUDADU, M. de A.; ZERLOTINI NETO, A. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2019
Plant Co-expression Annotation Tool: a tool to identify targets for proof of concept in Genetically Modified crop breeding pipelines. Autoria: VIANA, M. J. A.; ZERLOTINI NETO, A.; MUDADU, M. de A. The purpose of this work is to characterize PUFs to be used in GM crops pipelines using orthology, co-expression networks and other tools. To date, we have downloaded, analyzed, and processed genomic... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2019
Genotipagem por meio de marcadores SNP em cevada (Hordeum vulgare): um estudo de caso em cultivares e populações resultantes de retrocruzamentos. Autoria: MUDADU, M. de A.; LAU, E. Y.; PEREIRA, J. F.; MINELLA, E. Este documento representa o primeiro passo no sentido de aumentar a utilização de marcadores SNP em cevada por grupos de pesquisa no Brasil. As formas de obtenção e análise dos dados são detalhadas ut... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2019

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