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DIPN: a dictionary of the internal proteins nanoenvironments and their potential for transformation into agricultural assets. Autoria: MAZONI, I.; NESHICH, G. Introduction. Protein nanoenvironments and their characteristics: List of physicochemical and structural descriptors that characterize specific nanoenvironments. Contributions: what does knowledge abo... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2023
A comparison between internal protein nanoenvironments of ?-helices and beta-sheets. Autoria: MAZONI, I.; SALIM, J. A.; MORAES, F. R. de; BORRO, L.; NESHICH, G. In this paper we would first like to address a full characterization of the nanoenvironment found at beta sheet locations and then compare those characteristics with the ones we already published for... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2020
DPIN: um dicionário dos nanoambientes internos das proteínas e seu potencial para transformação em ativos para a agricultura. Autoria: MAZONI, I.; NESHICH, G. Introdução. Nanoambientes proteicos e suas características. Lista dos descritores físico-químicos e estruturais que caracterizam os nanoambientes específicos. Contribuições. Qual é o significado do co... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2020
Study of specific nanoenvironments containing [alfa]-helices in all-[alfa] and ([alfa]+[beta])+([alfa]/[beta]) proteins. Autoria: MAZONI, I.; BORRO, L. C.; JARDINE, J. G.; YANO, I. H.; SALIM, J. A.; NESHICH, G. Protein secondary structure elements (PSSEs) such as [alfa]-helices, [beta]-strands, and turns are the primary building blocks of the tertiary protein structure. Our primary interest here is to reveal... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2018
Binding affinity prediction using a nonparametric regression model based on physicochemical and structural descriptors of the nano-environment for protein-ligand interactions. Autoria: BORRO, L.; YANO, I. H.; MAZONI, I.; NESHICH, G. We propose a new empirical scoring function for binding affinity prediction modeled based on physicochemical and structural descriptors that characterize the nano-environment that encompass both ligan... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2016
Identification of snake bradykinin-potentiating peptides (BPPs)-simile sequences in rat brain: potential BPP-like precursor protein? Autoria: CAMPEIRO, J. D'A.; NESHICH, I. P.; SANT'ANNA, O. A.; LOPES, R.; IANZER, D.; ASSAKURA, M. T.; NESHICH, G.; HAYASHI, M. A. F. Bradykinin-potentiating peptides (BPPs) from the South American pit viper snake venom were the first natural inhibitors of the human angiotensin I-converting enzyme (ACE) described. The pioneer charac... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2015
Improving binding affinity prediction by using a rule-based model with physical-chemical and structural descriptors of the nano-environment for protein-ligand interactions. Autoria: BORRO, L. C.; SALIM, J. A.; MAZONI, I.; YANO, I.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. In order to improve binding affinity prediction, we developed a new scoring function, named STINGSF, derived from physical-chemical and structural features that describe the protein-ligand interaction... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2015
Induction of neutralizing antibodies against mutalysin-II from Lachesis muta muta Snake Venom Elicited by a conformational B-cell epitope predicted by Blue Star Sting data base. Autoria: MACHADO-DE-ÁVILA, R. A.; VELLOSO, M.; OLIVEIRA, D.; STRANSKY, S.; FLOR-SÁ, A.; SCHNEIDER, F. S.; NESHICH, G.; CHÁVEZ-OLÓRTEGUI, C. Mutalysin-II, from Lachesis muta muta snake venom, is an endopeptidase with hemorrhagic activity. To identify a conformational epitope we used Blue Star Sting, the latest version of the web based Stin... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2015
Computational Biology tools in design of an agrochemical against Xylella fastidiosa. Autoria: FULAZ, S. F.; CABRINI, F. M.; BORRO, L.; TASIC, L.; NESHICH, G. Since its pathogenicity is related to bacterial motility, the protein PilT from the twitching motility system has been chosen as the host target. Using rational drug design, based on a detailed compre... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2015
Computational biology tools in design of an agrochemical against Xyllela fastidiosa. Autoria: FULAZ, S. F.; CABRINI, F.; TASIC, L.; BORRO, L.; NESHICH, G. Xylella fastidiosa is a Gram-negative, non-flagellated bacterium that causes CVC in citrus and Pierce?s disease in grapevines. The CVC affects 40% of the 200 million orange trees in São Paulo state. I... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2015

Mostrando 1 - 10 de 73 resultados.

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