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Binding affinity prediction using a nonparametric regression model based on physicochemical and structural descriptors of the nano-environment for protein-ligand interactions. Autoria: BORRO, L.; YANO, I. H.; MAZONI, I.; NESHICH, G. We propose a new empirical scoring function for binding affinity prediction modeled based on physicochemical and structural descriptors that characterize the nano-environment that encompass both ligan... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2016
Identification of snake bradykinin-potentiating peptides (BPPs)-simile sequences in rat brain: potential BPP-like precursor protein? Autoria: CAMPEIRO, J. D'A.; NESHICH, I. P.; SANT'ANNA, O. A.; LOPES, R.; IANZER, D.; ASSAKURA, M. T.; NESHICH, G.; HAYASHI, M. A. F. Bradykinin-potentiating peptides (BPPs) from the South American pit viper snake venom were the first natural inhibitors of the human angiotensin I-converting enzyme (ACE) described. The pioneer charac... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2015
Improving binding affinity prediction by using a rule-based model with physical-chemical and structural descriptors of the nano-environment for protein-ligand interactions. Autoria: BORRO, L. C.; SALIM, J. A.; MAZONI, I.; YANO, I.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. In order to improve binding affinity prediction, we developed a new scoring function, named STINGSF, derived from physical-chemical and structural features that describe the protein-ligand interaction... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2015
Induction of neutralizing antibodies against mutalysin-II from Lachesis muta muta Snake Venom Elicited by a conformational B-cell epitope predicted by Blue Star Sting data base. Autoria: MACHADO-DE-ÁVILA, R. A.; VELLOSO, M.; OLIVEIRA, D.; STRANSKY, S.; FLOR-SÁ, A.; SCHNEIDER, F. S.; NESHICH, G.; CHÁVEZ-OLÓRTEGUI, C. Mutalysin-II, from Lachesis muta muta snake venom, is an endopeptidase with hemorrhagic activity. To identify a conformational epitope we used Blue Star Sting, the latest version of the web based Stin... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2015
Computational Biology tools in design of an agrochemical against Xylella fastidiosa. Autoria: FULAZ, S. F.; CABRINI, F. M.; BORRO, L.; TASIC, L.; NESHICH, G. Since its pathogenicity is related to bacterial motility, the protein PilT from the twitching motility system has been chosen as the host target. Using rational drug design, based on a detailed compre... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2015
Computational biology tools in design of an agrochemical against Xyllela fastidiosa. Autoria: FULAZ, S. F.; CABRINI, F.; TASIC, L.; BORRO, L.; NESHICH, G. Xylella fastidiosa is a Gram-negative, non-flagellated bacterium that causes CVC in citrus and Pierce?s disease in grapevines. The CVC affects 40% of the 200 million orange trees in São Paulo state. I... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2015
Utilização da biologia computacional para desenvolvimento de inibidores para a serino proteases do veneno da Crotalus durissus cumanensis. Autoria: SANTOS, R. V. dos; NESHICH, G. Na América Latina, picadas de cobras apresentam um grande problema na área de saúde publica. Estima-se que por ano ocorra 130.000-150.000 casos com 2.300 mortes em toda a região. Venenos de cobra são... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2014
Improving predictions of protein-protein interfaces by combining amino acid-specific classifiers based on structural and physicochemical descriptors with their weighted neighbor averages. Autoria: MORAES, F. R. de; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; YANO, I. H.; PEREIRA, J. G. C.; SALIM, J. A.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Protein-protein interactions are involved in nearly all regulatory processes in the cell and are considered one of the most important issues in molecular biology and pharmaceutical sciences but are st... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2014
Biologia computacional molecular e suas aplicações na agricultura. Autoria: JARDINE, J. G.; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; YANO, I. H.; MORAES, F. R. de; SALIM, J. A.; BORRO, L.; NISHIMURA, L. S.; NESHICH, G. Biologia computacional, uma nova ciência aplicada. Desenho racional de drogas, fármacos e agroquímicos. Biologia computacional na Embrapa. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2014
Identification of new Sphingomyelinases D in pathogenic fungi and other pathogenic organisms. Autoria: DIAS-LOPES, C.; NESHICH, I. A. P.; NESHICH, G.; ORTEGA, J. M.; GRANIER, C.; CHÁVEZ-OLORTEGUI, C.; MOLINA, F.; FELICORI, L. Sphingomyelinases D (SMases D) or dermonecrotic toxins are well characterized in Loxosceles spider venoms and have been described in some strains of pathogenic microorganisms, such as Corynebacterium... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2013

Mostrando 1 - 10 de 52 resultados.

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