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PDB-Metrics: a web tool for exploring the PDB contents. Authorship: FILETO, R.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; RIBEIRO, A. A.; QUINALIA, T. G.; FRANCO, E. H.; MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; OLIVEIRA, S. R. M.; SANTOS, E. H.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; CRUZ, S. A. B.; NESHICH, G. Abstract. PDB-Metrics (http://sms.cbi.cnptia.embrapa.br/SMS/pdb_metrics/index.html) is a component of the Diamond STING suite of programs for the analysis of protein sequence, structure and function.... ... Repository: BDPA Publication year: 2006
Building multiple sequence alignments with a flavor of HSSP alignments. Authorship: HIGA, R. H.; CRUZ, S. A. B. da; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; FILETO, R.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. The present study describes the processing used for building SH2QS as well as a comparison of the degree of residue conservation reported by SH2QS and HSSP. The comparison of the profiles from two ali... ... Repository: BDPA Publication year: 2006
Uma arquitetura para sistema de informação sobre solos voltada para o zoneamento agrícola. Authorship: FILETO, R.; ASSAD, M. L. R. C. L.; SILVA, J. dos S. V. da; SOARES, A. F.; VENDRUSCULO, L. G. A disponibilidade de informação sobre solos é fundamental para a tomada de decisão no agronegócio. Para cobrir tal demanda, os dados devem ser coletados de diversas fontes, integrados e processados po... ... Repository: BDPA Publication year: 2005
The Diamond Sting server. Authorship: NESHICH, G.; BORRO, L. C.; HIGA, R. H.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; FRANCO, E. H.; KRAUCHENCO, J. N.; FILETO, R.; RIBEIRO, A. A.; BEZERRA, G. B. P.; VELLUDO, T. M.; JIMENEZ, T. S.; FURUKAWA, N.; TESHIMA, H.; KITAJIMA, K.; BAVA, A.; SARAI, A.; TOGAWA, R. C.; MANCINI, A. L. Diamond STING is a new version of the STING suite of programs for a comprehensive analysis of a relationship between protein sequence, structure, function and stability. We have added a number of new... ... Repository: BDPA Publication year: 2005
Grau de conservação de aminoácidos de proteínas: comparação entre entropia relativa e pressão evolucionária. Authorship: HIGA, R. H.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; MOURA, M. F.; FILETO, R.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. Este trabalho apresenta uma comparação entre essas duas medidas utilizadas para medir o grau de conservação de aminoácidos, entropia relativa e pressão evolucionária. Repository: BDPA Publication year: 2004
Modelagem molecular da proteína small heat shock de Xylella fastidiosa. Authorship: FALCAO, P. R. K.; TADA, S. F. de S.; SOUZA, A. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; FILETO, R.; HIGA, R. H.; NESHICH, G. Este documento descreve o modelo molecular da proteína XF2234 e a análise preliminar da sua estrutura. O modelo foi construído por modelagem por homologia (ou modelagem comparativa) com a estrutura cr... ... Repository: BDPA Publication year: 2004

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