A sede da Embrapa Gado de Leite está instalada numa área de 3,85 hectares, em Juiz de Fora (MG), onde estão instalados salas de trabalho, laboratórios, casas de vegetação, auditórios, biblioteca e escritórios de parceiros, como o Pólo de Excelência do Leite e associações de criadores.

A infraestrutura conta, ainda, com o Laboratório Multiusuário de Bioeficiência e Sustentabilidade da Pecuária, doze laboratórios de pesquisa, dois laboratório de prestação de serviço externo e pesquisa, dois Campos Experimentais, quatro Núcleos Avançados de Apoio à Transferência de Tecnologia.